Minyak atsiri menguap dengan cepat saat bersentuhan dengan udara, dan kualitasnya mudah menurun jika terkena cahaya. Suhu ekstrem-terlalu tinggi atau terlalu rendah-serta paparan udara, semuanya merusak pelestariannya. Minyak atsiri biasanya dikemas dalam botol kaca berwarna gelap dan kedap udara; idealnya, minyak tersebut tidak boleh disimpan dalam botol yang dilengkapi dengan penetes karet, karena beberapa minyak esensial tertentu dapat menimbulkan korosi pada karet. Kecuali Bergamot, minyak atsiri jeruk cenderung terdegradasi dan menjadi tengik dalam waktu yang relatif singkat. Jika Anda mendeteksi bau yang tidak biasa, asam, atau tidak-, ini menunjukkan bahwa oli sudah tidak layak digunakan. Sebaliknya, kualitas minyak atsiri tertentu justru meningkat seiring bertambahnya usia-fenomena yang biasa diamati pada minyak yang berasal dari akar dan kayu.
Minyak atsiri harus disimpan di tempat sejuk dengan kondisi suhu-ruangan yang relatif stabil. Menyimpannya di lemari es umumnya tidak disarankan, karena fluktuasi suhu yang signifikan dapat berdampak buruk pada kualitasnya. Minyak atsiri murni sensitif terhadap cahaya dan rentan terhadap oksidasi; oleh karena itu, selain disimpan dalam botol-berwarna gelap, sebaiknya disimpan di lingkungan gelap dengan suhu konstan sekitar 30 derajat atau lebih rendah. Namun minyak pembawa (minyak nabati) cocok untuk didinginkan. Minyak atsiri yang tertelan secara tidak sengaja dapat menyebabkan efek samping yang merugikan dan berpotensi menimbulkan risiko kesehatan yang serius; mereka harus dijauhkan dari jangkauan anak-anak.
Setelah dibuka, minyak atsiri harus ditangani dengan hati-hati setelah digunakan: pastikan tutupnya terpasang erat, dan bersihkan sisa minyak yang mungkin meresap ke leher botol untuk mencegah oksidasi.
Minyak esensial murni 100%-seperti Cendana, Kemenyan, Nilam, dan Vetiver-biasanya dapat disimpan selama beberapa tahun. Sama seperti anggur berkualitas, minuman ini bahkan mungkin melunak dan membaik seiring bertambahnya usia; namun, kita harus tetap waspada terhadap risiko oksidasi, karena paparan udara (dengan membiarkan tutup terbuka) dapat dengan mudah menyebabkan kerusakan oli. Sebaliknya, beberapa minyak atsiri tidak memiliki umur simpan yang lama; misalnya, sebagian besar minyak jeruk (kecuali Bergamot) hanya memiliki umur simpan dua tahun.
Minyak atsiri yang telah diencerkan dengan minyak pembawa (minyak dasar) memiliki umur simpan yang jauh lebih pendek-biasanya sekitar tiga bulan-meskipun jangka waktunya dapat bervariasi. Meskipun demikian, sangat disarankan agar campuran tersebut dikonsumsi secepat mungkin. Oleh karena itu, saat membeli campuran minyak esensial jenis ini, penting untuk memperhatikan tanggal kedaluwarsa spesifiknya.
